核糖體肽是自然界通過翻譯后修飾化學創(chuàng)造的一類結(jié)構(gòu)復雜、活性優(yōu)良的肽類天然產(chǎn)物。許多有廣泛應(yīng)用的抗生素，如乳酸鏈球菌素和硫鏈絲菌素，均通過翻譯后修飾化學從20種天然氨基酸構(gòu)成的簡單多肽轉(zhuǎn)化而來。上海有機所劉文課題組長期從事富硫細菌環(huán)肽的翻譯后修飾化學研究，近期對相關(guān)肽的主鏈骨架修飾、氮雜核心環(huán)的形成以及非天然氨基酸的引入等酶促反應(yīng)過程進行了剖析（J. Am.Chem.Soc.2020, 142,8454–8463;J.Am.Chem.Soc.2021,143,13790-13797;?Cell?Chem.Biol.?2021,28,?675-685;J.Am.Chem.Soc.2022,144,4431-4438）。
賽普霉素是鏈霉菌產(chǎn)生的一類核糖體肽，具有顯著抑制藤黃微球菌和小鼠白血病細胞生長的作用。自發(fā)現(xiàn)以來三十余年，人們對該類核糖體肽的翻譯后修飾過程知之甚少?；谇捌诠ぷ骰A(chǔ)，劉文課題組對該分子的骨架形成機制展開了研究。研究結(jié)果修正了賽普霉素的化學結(jié)構(gòu)：除了已知的脫氫丁胺酸殘基外，該分子還含未被發(fā)現(xiàn)的11個D型氨基酸殘基，表明賽普霉素是一種長期以來被低估了的高度修飾核糖體肽。研究發(fā)現(xiàn)，僅由兩個膜蛋白的共同作用，便能催化肽鏈上的4個蘇氨酸脫水、1個半胱氨酸脫硫和11個氨基酸（3個丙氨酸、2個纈氨酸、2個天冬酰胺、2個異亮氨酸、2個脯氨酸）發(fā)生差向異構(gòu)化反應(yīng)。
研究證明，上述三種后修飾反應(yīng)在化學機制上是一致的。脫水反應(yīng)、脫硫反應(yīng)和差向異構(gòu)化反應(yīng)可以互換，例如將?D 型氨基酸位點突變蘇氨酸，后修飾過程中該位點發(fā)生了脫水反應(yīng)；將蘇氨酸位點突變?yōu)榘腚装彼釀t發(fā)生了脫硫反應(yīng)。通過同位素標記實驗，證明差向異構(gòu)化反應(yīng)只斷裂Ca-H鍵，從而支持上述反應(yīng)經(jīng)歷相同的Ca烯醇化過程。盡管自然界存在多種脫水酶、消旋酶和脫硫酶，但從未發(fā)現(xiàn)在多肽水平上由相同化學機制串聯(lián)起三種反應(yīng)的酶促機制。該發(fā)現(xiàn)為這種高普適性、高底物泛雜性的氨基酸殘基翻譯后修飾化學提供了有力證據(jù)，并為解析該后修飾過程的分子機制打下良好基礎(chǔ)。通過前體肽的工程化改造，獲得了三十余種賽普霉素類似物，有助于探究賽普霉素的構(gòu)效關(guān)系，以及通過合成生物學方法獲得更高產(chǎn)量和更高活性的賽普霉素變體。
該研究成果近期在“Journal of the American Chemical Society”上發(fā)表（DOI：10.1021/jacs.3c01730）。有機所博士生薛彥青和博士后王曉峰為共同第一作者，劉文研究員為通訊作者。感謝上海有機所公共技術(shù)服務(wù)中心王昊陽老師和宋瑋老師在分析方面提供的大力支持。該工作得到科技部、國家自然科學基金委相關(guān)基金的大力資助。
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